Кеширование отключите и очистите папку кеша.
посмотрите какая ошибка выводится в консоли, два варианта при наведении: с помощью скрипта hover ,тогда класс добавляется при наведении - ошибка в консоли видна, или с помощью стилей css :hover. В зависимости от этого и искать, что слетело.
ККК у вас не включено?
Выключите все пункты в ККК. От склейки и перемещния в конец js могут быть ошибки.
Консоль в браузере запустите, покажет ошибки в javascript. Так можно определить причину.
Можно попробывать сбросить настройки темы и потом заново настроить.В теме warehouse подключения js, css зависит от настроек.