В файл header.tpl добавить код пикселя. Добавляется как и любой код javascript. На форуме полно тем о том, как вставить код javascript в файлы темы. Можно взять пример вставки Pixel Facebook Prestashop
У меня их много получается 250 штук куда именно
Пример
/public_html/prestigerus.ru/modules/homeslider/views/templates/hook/header.tpl
/public_html/prestigerus.ru/modules/smartblog/views/templates/admin/helpers/tree/tree_associated_header.tpl
/public_html/prestigerus.ru/modules/smartblog/views/templates/front/plugins/blogfeedheader.tpl
/public_html/prestigerus.ru/pdf/supply-order-header.tpl
/public_html/prestigerus.ru/pdf/header.tpl