Микророзметку нужно добавлять во все шаблоны, которые выводят товары. В теме prestashop это product.tpl и product-list.tpl. Еще в модулях, которые используются для показа товаров.
В теме prestashop 1.6 микроразметка добавлена. В шаблоне product.tpl
itemtype="https://schema.org/Product"
...