Модуль может переопределить контроллеры/классы. Посмотрите папку /override/, удалите классы и контроллеры из этой папки (за исключением тех, что вы добавляли сами).
Чтобы сохранить внешний вид, нужно сохранить папку /themes/ваша тема/
Товары экспортировать из базы данных в файл csv, потом импортировать на новый сайт.