Этот модуль называется Store Manager for PrestaShop и просто облегчает управление магазином. Он не дает возможности использовать несколько магазинов на одном домене. Для этого можно создать под-домены. Если товары разные, то нет смысла использовать общую базу. Для управления экспортировать заказы и клиенов на десктоп.