Может у вас не указанны альясы с www и без www и нужно указать Domain: www.site1.ru.
При настройке мультимагазина ненужно использовать редирект.Поставьте да в основной url и активный.
В настройках каждого магазина.
Вы пишите, что все настроено. По вашим словам, вы все правильно заполнены. Но у вас почему-то не работает.Проблема или в настройках домена, или установленых файлах prestashop. Переустановите prestashop, может это решит проблему.
Что-то с хостингом. Смотрите, у вас сайты работают, мульти магазина настроен. Остается только хостинг. Напишите в тех.поддержку хостинга, попросите помочь.
кто-то на практике в итоге настраивал рабочие проекты через псевдонимы?
не будет ли проблем с сео при данной настройке?
301 редирект в htaccess, альясы в конфигурационом файле веб.сервера не создают проблем при индесации.
Зачем вам 301 редирект в htaccess для мультидомена?Правила в htaccess создается атоматом при включении чпу в админке.