Удаление данных только из одной таблицы небезопасно. Это может вызвыть проблемы в показе статистики магазина. В prestashop таблицы связанны между собой, поэтому очищать нужно сразу в нескольких таблицах. Если вы не разбираетесь в этом вопросе, то используйте специальные модули для очистки логов., такие как Prestashop Cleaner, Prestashop Clean DB, Prestashop Optimize Store DB.