У вас изменены шаблоны этого модуля. После обновления нужно вернуть старые шаблоны tpl-файлы. Тогда должно работать.
Вы имеете ввиду blocktopmenu.tpl из соответствующей папки?
или в /themes/default-bootstrap/modules/blocktopmenu?
Еще может быть добавлены стили в файл css. Сравнить новый и страрый, если есть разница, то перенести недостающие в новый файл.
blocktopmenu.css в папке blocktopmenu/css он пустой или
в themes/default-bootstrap/css/modules/blocktopmenu/css?
там еще superfish-modified.css..
Сложновато мне..
Не очень понятно почему после полного (или почти полного) удаления модуля и его папок,
не обновляются и шаблоны модуля?! Или они хранятся вне этих папок? Ну и собственно, вручную я ничего не менял вроде.
Меня также смущает то, что модули у меня не удаляются полностью из админки.