Если поврежден файл конфтгурации, то автоматом установить шаблон не получится. Нужно отключить все модули, установить тему, перегенерировать изображения и подключать модули, проверяя каждый раз после подключения шаблон. Если модуль неправильно позиционируется, удалять его или менять хук вывода в Модули -> Расположение блоков.