Зачем так сложно? Простой способ - Отключить ЧПУ и изменить домен, потом перенести сайт.
1. На локалке, в админке магазина
Настройка -> SEO и URL, отключаете ЧПУ.
2. Можете сразу исправить домен.
Настройка -> SEO и URL -> Установить магазин URL : новый домен.
3. Переносите на сервер без проблем (не забываем поравить в settings.inc.php данные подключения к бд).
таблицу id_shop_url
Адрес можно изменить после переноса в таблице : ps_shop_url