Для этого нужно отредактировать статус заказа, который присваивает модуль оплаты.
Панель управления > Заказы > Статусы
Выбираете статус. Например, для модуля оплаты через банк статус "В ожидании оплаты банком", редактируете.
Пошлите электронное письмо клиенту, когда статус заказа изменен - Нет
Разрешать покупателю скачивать и просматривать счет в виде PDF документа. - Да