В стандарной теме корзина выводится нормально. У вас свои шаблоны для корзины. Модули, такие как onepagecheckout, подменяют шаблоны темы. Если у вас установлен такой модуль, то проблема может быть в нем.
Проверьте код страницы, смотрите таблицу корзины, в коде можно проверить парность тегов, количество колонок в таблице, стили.