Попробывал на prestashop 1.6.0.9, тоже работает без проблем. Все товары показывает. Пробывал удалять все товары и категории, через модуль очистки prestashop, потом создавал заново. Работает. Все товары в наборе выводит. До 50 товров добавлял и нормально.
Попробуйте очистить prestashop модулем Database Cleaner (Модули - Администрирование).
Потом создайте новые пару простых товаров и один набор с этими товарами. Категорию поставьта Home.
После проверки добавляйте по одному простому, меняйте набор и проверяйте.