Зайдите по root. Попробуйте изменить права у этого файла на 666.
Измените на 666. После этого удалите.
Или вирус, сервер взломан. Или у вас не root доступ.Вам нужно проверить и настроить хостинг. Заходя по фтп в вас не должно быть ограничений на удаление или изменение файлов.