Смотря как добавлять. Через редактор, нужно добавить кнопку вставку js кода. Была такая тема, как установить расширенный виз.редактор. А если напрямую в шаблоны, то теги literal нужно добавить.
Была тема как добавить ссылку на видео с youtube используя поле штрих-код для подстановки ид видео. Там описывали какие шаблоны менять.