Проверить какие страницы открыты для индексации можно в инструментах веб.мастера yandex/google.
Фильтрация это смена адреса страницы, но контент остается прежним. Поисковик воспринимает страницу отфильтрованной выдачи как новую страницу. Но так как она содержит дублирующийся контент (описание, заголовки и т.д.), то это плохо.
Можно в файле robots.txt разрешить индексацию только страниц категорий и по страницную разбивку, а отфильтрованные страницы (по цвету, размеру и т.д) запретить.
Разрешать индекспцию нужно только тогда, когда у вас будет меняться содержимое. Например, при применении фильтра будут меняться заголовки, картинки, описание ... Так можно повысить содержание страниц в выдаче поисковика.