Это не очень хороший вариант, но раз другого нет, то можно пробывать и с ним.
В этом же модуле советывают сделать архив в ручную.
Пожалуйста, всегда создавайте полную резервную копию ваших файлов и базы данных в ручном режиме до начала процесса обновления. Обязательно убедитесь в целостности вашей резервной копии и в том, что вы сможете ее восстановить в ручном режиме при необходимости.
Лучший вариант, это архив сделанный в ручную.
1. Через phpMyAdmin сделать экспорт базы данных
2. Сделать архив всех файлов из корневой папки сайта.
Такой архив можно использовать много раз. Распаковал файлы, удалил все файлы с корневой папки и перенес туда распакованные.
Потом удалил все таблицы в бд и сделал импорт сохранненой базы данных.
Тоже самое можно сделать с архивом модуля Обновление в 1 клик.
Но сначала попробывать востановить через модуль.
В модуле нажать Настроить, потом выбрать в блоке Откат файл архива и нажать кнопку Откат.
Если не получиться, то распаковывать архивные файлы и востанавливать в ручную, выше написал как это сделать.