Файлы из папки /js/ забыли перенести.
Еще недостающие модули из /modules/.
Дополнить классы методами, которые нужны для новых тем. Сравнивайте 2 одинаковых файла из новой и старой версии, так можно увидеть все измения. Просто перенести папку с новой темой не получиться.